Para estos casos nos será de mucha utilidad un pequeñito pero muy útil programa llamado NoDrives Manager.
Para utilizarlo, primeramente descargamos el programa y lo instalamos, la interface del software muestra todas las letras de unidad, simplemente seleccionamos las que queremos ocultar y clicamos en Save changes (Guardar los cambios)
Automáticamente el sistema nos notifica que deberemos reiniciar Explorer para que los cambios sean aplicados.
Una vez reiniciado el sistema comprobamos que las unidades que hemos seleccionado ya no aparecen en la lista de unidades del sistema operativo.
NoDrives Manager es compatible con todas las versiones de Windows, ya sea en x32 o x64 BITS.
En los links de descargas disponible la versión portable de NoDrives Manager